A divisão de Imunização é responsável pela realização das campanhas de vacinação em Rio Claro. Gerencia o controle, a distribuição e a utilização de imunobiológicos, além de oferecer assessoria técnica aos Distritos Sanitários e Unidades de Saúde em Rio Claro. O SUS oferece aos cidadãos todas as vacinas do calendário vacinal, conforme a faixa etária indicada.
O objetivo do programa é manter coberturas vacinais dentro das metas preconizadas pelo Programa Nacional de Imunizações do Ministério da Saúde (PNI/MS), visando o controle, a eliminação ou a erradicação das doenças imunopreveníveis. O foco do trabalho é garantir um Programa de Imunizações municipal integrado e qualificado no atendimento à população. Para isso, são realizadas ações regulares de vacinação, incluindo a vacinação de rotina com as vacinas obrigatórias, as estratégias especiais, como campanhas, vacinações de bloqueios e de grupos especiais, além de notificação e investigação de eventos adversos e inusitados associados à vacinação.